Злодеи - это персонажи, которые противостоят главным и некоторым второстепенным героям в Happy Tree Friends. Большинство из них кого-либо убили.
Злой Флиппи (англ.Evil Flippy, также известен как Angry Flippy)
Злобное альтер - эго Флиппи. Начиная с эпизода Hear Today, Gone Tomorrow, Флиппи сражался с ним и наконец победил.
Проклятый Идол (англ. Cursed Idol)
Статуэтка индейцев Майя приносящая гибель всем кто к ней прикоснётся. Появляется в эпизодах Treasure These Idol Moments, Hello Dolly, и Idol Curiosity, Crazy Antics, Happy Trails Pt. 1, Milkin' It, Class Act, Ipso Fatso, Who's to Flame? и Every Litter Bit Hurts.
Демон (англ. The Demon)
Демон первый, и пока единственный раз появился в "Read 'em and Weep". Папаша вызвал его, прочитав книгу черной магии. Демон не имеет головы, а только рот.
Муравьи
Всякий раз, когда Муравьи появляются в эпизоде, Ботаник пытается съесть их, что приводит его к мучительным пыткам и особо ужасной смерти.
Случайные Лесные Ниндзя
Специальная группа Случайных Лесных Друзей, которая терроризирует священые места, где живёт Обезьяна - Буддист. Эти тёмные ниндзя появляются исключительно в эпизодах про Обезьяну - Буддиста: "Enter the Garden", "Books of Fury", и "Three Courses of Death" (а также в эпизоде "Keepin' it Reel", где ниндзя появляются на киноэкране). В "Enter The Garden", ниндзя носят зеленую одежду с листом на груди, а в "Books of Fury", они носят коричневую одежду с раскрытой книгой на груди.
Крыса
Крыса появился только в эпизоде "Mole in the City". Он, видимо, самый главный враг Крота. Они оба участвовали в Промышленном Шпионаже, и Крыса был убит взрывчатыми веществами, которые Крот заложил в его портфеле. Возможно, что он погиб навсегда.
Тигриные Солдаты
Цвета они синего, как и их командир, но ростом куда ниже. Носят шлемы, нередко защитные очки, вооружены огнестрельным оружием. Типичные "имперские штурмовики", "пешки" и пушечное мясо.
Тигриный Командир
Тигр синего цвета, в униформе с эполетами, фуражке и с кибернетическими усовершенствованиями (фотоэлемент вместо левого глаза и клешня вместо левой руки). Фанаты чаще всего зовут его Генералом, хотя о его ранге нигде не сказано. Впервые появился в "Operation: Tiger Bomb".
Тёмный Лорд Теней
Неизвестный персонаж в тени - это злой хозяин, который послал Случайных Лесных Ниндзя и Чар Суя убить Обезьяну - Буддиста. Сам же он следит за Обезьяной - Буддистом в свой волшебный котёл.
Чар Суй
Чар Суй - один из наёмников Тёмного Лорда Теней, посланный убить Обезьяну - Буддиста. Как и Случайные Лесные Ниндзя, он провалил задание и был убит Обезьяной - Буддистом в эпизоде "Three Courses of Death". У него есть гигантский фиолетовый краб, которого он использовал для выполнения своей миссии, тем не менее они оба были сварены Макаком в кипятке.
Сплендонт
Сплендонт - это противостоящий Сплендиду супергерой. Он был заточён в зеркале, которое летало в космосе и было разбито камнем. Возможно, что Сплендонт вернётся в будудущих эпизодах Splendid's SSSSSuper Squad.
Мистер Пиклс
Маленький воображаемый друг Лэмми. У него есть усы, также он носит цилиндр. Лэмми о нём очень хорошего мнения, хотя он всегда учиняет различные беспорядки - от отрывания головы плюшевого медвежонка до переезда Умейки на грузовике.
Мистер Пиклс появлялся в сериале трижды (вместе с Лэмми). Является единственным персонажем, который не относится к животным.